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comparer des molécules pour déterminer les conformations les plus similaire

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compsortall Note de la rédaction

Outil de ligne de commande permettant de comparer des fichiers de données délimités par des virgules en utilisant des différences relatives pour déterminer les conformations les plus similaires. Compsortall compare les fichiers de données en utilisant la différence relative, calcule un score de similarité, trie les scores du noyau par ordre croissant (les valeurs basses représentent une similarité plus grande), enregistre tous les scores dans un fichier texte. Les fichiers de données produits par l'utilisateur doivent être des fichiers texte délimités par des virgules. Chaque fichier représente une molécule unique. Chaque ligne d'un fichier représente une conformation unique de la molécule. La première colonne du fichier de données doit être une étiquette unique à la conformation représentée par la ligne. Les autres colonnes sont des descripteurs numériques, tels que des mesures d'espace-distance. Les lignes sont comparées de manière combinatoire entre les fichiers. Les étiquettes comparées sont concaténées et enregistrées avec les notes de l'ensemble des lignes. Ceci fournit un moyen d'identifier les conformations qui ont produit un score de similarité donné.

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