compsortall Specifikationer
|
sammenlign molekyler for at bestemme de fleste lignende konformatione
Kommandolinjeværktøj til sammenligning af komma-afgrænsede datafiler ved hjælp af relative forskelle for at bestemme de mest lignende konformationer. Compsortall sammenligner datafilerne ved hjælp af relativ forskel, beregner en lighedsscore, sorterer scorerne ud af kernen i stigende rækkefølge (lavere værdier repræsenterer større lighed), gemmer alle scoringer i en tekstfil. De datafiler, der produceres af brugeren, skal være kommaseparerede tekstfiler. Hver fil repræsenterer et unikt molekyle. Hver række i en fil repræsenterer en unik konformation af molekylet. Den første kolonne i datafilen skal være en etiket, der er unik for konformationen repræsenteret af rækken. Resten af kolonnerne er numeriske deskriptorer, såsom afstandsrummålinger. Ræderne sammenlignes kombinationsmæssigt mellem filer. Etiketterne i sammenligning er sammenkædede og gemt med scorerne for rækken. Dette giver en måde at identificere de konformationer, der frembragte en given lighedsscore.
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |
![]() |