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Suchen und Auswählen von Oligonukleotiden aus einer Sequenzdatei für die Polymerase-Kettenreaktion

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OLIGO ist ein multifunktionales Programm, das Oligonukleotide aus einer Sequenzdatei für Polymerase-Kettenreaktion (PCR), DNA-Sequenzierung, ortsgerichtete Mutagenese und verschiedene Hybridisierungsanwendungen sucht und auswählt. Es berechnet die Hybridisierungstemperatur und die Sekundärstruktur von Oligonukleotiden basierend auf den thermodynamischen Werten des nächsten Nachbarn. Es ist auch ein gutes Werkzeug für die Konstruktion synthetischer Gene, das Auffinden eines geeigneten Sequenzierungsprimers unter den bereits synthetisierten, das Auffinden und Multiplexen von Consensus-Primern und -Sonden und sogar das Auffinden potenzieller Restriktionsstellen in einem Protein. Die OLIGO-Software ist weithin als Industriesoftwarestandard für die Auswahl und Analyse von Oligonukleotiden für verschiedene molekularbiologische Anwendungen anerkannt. Die erste kommerzielle Version der Software wurde 1989 eingeführt.

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